AMBER on Tesla GPUs
AMBER의 explicit solvent와 implicit solvent시뮬레이션이 CUDA 지원 GPU를 통해 가속화되었습니다. CUDA 아키텍처를 기반으로 구축된 Tesla GPU 컴퓨팅 솔루션과 통합 환경을 제공하여 싱글 쿼드 코어 CPU보다 최대 10배 이상 빠른 속도를 제공합니다.
다운로드 및 설치
- AMBER 11 다운로드(CUDA GPU 지원)
- Implicit Solvent Generalized Born 시뮬레이션
- NVE, NVT 및 NPT 정준 앙상블에서 지원되는 Explicit Solvent PME 시뮬레이션
- 다운로드 페이지에서 설치 가이드도 제공합니다.
벤치마킹 데이터
Explicit Solvent PME 및 Implicit Solvent GB 벤치마크를 위한 벤치마크 데이터. 자세한 내용은 샌디에이고 슈퍼컴퓨팅 센터가 제공하는 AMBER 11 NVIDIA 벤치마크 페이지에서 확인할 수 있습니다.
 |
 |
기술 문서 및 프레젠테이션
- AMBER 11 GPU 가속에 기반을 둔 새로운 제품이 곧 출시됩니다.
- SC09: AMBER에서 NVIDIA CUDA 지원 개요- 학습 및 성과 – 2009 GPU 기술 컨퍼런스에서 샌디에이고 슈퍼 컴퓨팅 센터, Ross Walker 발표
- 2009 GPU 기술 컨퍼런스: GPU를 이용하는 전산 생물 물리학 및 광범위한 정전기학 – (Long Range Electrostatics) – NVIDIA, Scott Le Grand 발표
- GPU를 사용한 분자 역학 어플리케이션 가속화에 관한 추가 문서
- GPU를 사용한 양자 화학 어플리케이션 가속화에 관한 추가 문서
토론 포럼
인터뷰 / 비디오
- NVIDIA nTersect의 SC09 BLOG: AMBER 리서치 코드, NVIDIA CUDA를 이용하여 우수한 결과 실현
GPU 솔루션
Tesla Bio Workbench 어플리케이션은 GPU 기반의 개인용 데스크톱 슈퍼컴퓨터 또는 데이터 센터 솔루션에 활용이 가능합니다. 혁신적인 대규모 병렬 CUDA 아키텍처를 기반으로 하는 이러한 솔루션은 계산 과학의 진보를 가속화하도록 설계되었습니다.
권장 하드웨어 구성
| 데스크톱 워크스테이션 구성 | 데이터 센터 구성 |
|
|
 |
 |
|
